El nombre del municipio de Santo Tomás se asigno durante la época de la colonia, fue adoptado de uno de los apóstoles y por la introducción de las huembas de plátanos, este nombre se implementó por primera vez en 1975, cuando era gobernador del estado, el prof. Carlos Hank González.

Santo Tomás, se encuentra rodeado por varias presas del viejo sistema hidroeléctrico Miguel Alemán. El pueblo lo mudaron a seis kilómetros al noroeste de lo que anteriormente era el antiguo asentamiento, con la finalidad de poder construir la Presa de Santa Bárbara.

Si visitas este municipio, no olvides ir a la Presa Santa Bárbara, es un excelente sitio para la pesca de carpa y donde podrás notar que sobresale del agua, la torre de la antigua parroquia. Al norte se encuentra la Barranca del Diablo, de cuatrocientos metros de profundidad y sobre sus paredes existen pinturas rupestres que pueden visitarse con ayuda de un guía o pasear en el paraje de Ixtapantongo, tres kilómetros antes de llegar a Santo Tomás de los Plátanos, cuya planta hidroeléctrica de 1938, fue la primera que puso en operación la Comisión Federal de Electricidad.